Microbiologie 

Les bactéries sont des organismes unicellulaires dont les dimensions sont de l'ordre du micromètre; on doit donc utiliser un microscope pour les observer.

SOURCES

Termes

Scissiparité : reproduction asexuée par simple division de l'organisme

JS

Bactériologie générale
Les procaryotes sont les bactéries, des organismes unicellulaires qui peuvent parfois constituer des colonies peu structurées. Les bactéries ont diverses formes : bâtonnet (les bacilles), sphérique (les Cocci ou Coccus), spirale (les spirilles)...

Saprophytisme

1. Un organisme est dit saprophyte (σαπρός pourri, φῠτό plante) s'il est capable de se nourrir de matière organique en décomposition

2. Les micro-organismes saprophytes vivent dans l'eau, l'air ou le sol sans dépendre d'un autre être vivant. Ils se nourrissent de matières organiques en décomposition et la transforment en matière minérale

Commensalisme

1. Le commensalisme (du latin co-, avec mensa, table : compagnon de table) est un type d’association naturelle entre deux êtres vivants dans laquelle l'hôte fournit une partie de sa propre nourriture au commensal : il n’obtient en revanche aucune contrepartie évidente de ce dernier (la relation est à bénéfice non-réciproque).

La symbiose est une association intime et durable entre deux organismes hétérospécifiques (espèces différentes)^[

1. la symbiose n'est pas une association à bénéfices réciproques ("gagnant et gagnant") comme habituellement énoncé Elle l'est dans le sens où "survivre c'est transformer les inconvénients en avantages et éviter que les avantages deviennent des inconvénients "^[3], pour éventuellement se survivre. La symbiose est une association à caractère obligatoire et à avantages et inconvénients réciproques et partagés, entre partenaires ("locaux") inséparables, et, les bénéfices ("globaux") sont pour la nouvelle entité émergente

2. Exemples de symbioses

• Le lichen est une union entre une algue microscopique et un champignon.

• L'intestin humain contient plus de 200 espèces de bactéries comme Escherichia coli, cette microflore représente chez un adulte plus d'un kilo de biomasse. Elles ont un rôle favorable dans la digestion, dans la régulation du système immunitaire et empêchent la colonisation par des organismes pathogènes.

• L’acacia cornigera ne peut survivre qu’avec une colonie de fourmis

• Les branches du barteria, naturellement creuses, offrent à une espèce de fourmis, les tetraponera, un confort sans égal. Mais en plus d'offrir un gîte, l'arbre propose aux fourmis une table garnie en permanence grâce aux bords de ses feuilles parsemés de glandes à nectar que celles-ci récoltent à longueur de journée. En échange des services rendus, les fourmis offrent à l'arbre une protection pour contrer ses ennemis jurés : les mangeurs de feuilles. Les tetraponera possèdent, en effet, à l'extrémité de leur abdomen un redoutable dard venimeux, et de plus, elles éliminent les lianes et lichens qui viennent déranger leur arbre préféré.

INTRODUCTION

• Procaryotes Bactéries : de l'ordre de 0,5 à 3 µm (pour la largeur), pas de limite en longueur ; le pouvoir séparateur de l'œil humain est de 100 µm, ces micro-organismes sont donc tous invisibles à l'œil nu.

• Eucaryotes : très variable de 2 à 200 µm (pour la largeur), pas de limite en longueur ; certains eucaryotes sont visibles à l'œil nu (notamment les algues), d'autres ne sont visibles que sous forme d'agrégats (cas des champignons, dont les parois plasmiques émettent des filaments sur une grande longueur relativement à leur taille). Tous les eucaryotes ne s'aggrègent pas ainsi (notamment les protozoaires, invisibles à l'œil nu).

Les organismes vivants contiennent des organes constitués de tissus faits de la juxtaposition de cellules. La cellule est une structure physique qu'on retrouve chez tous les êtres vivants. Elle possède un cytoplasme et un noyau limités l'un et l'autre par une membrane cytoplasmique ou nucléaire.

Des différences morphologiques importantes existent entre cellules des règnes végétal et animal mais la place des bactéries restait mal précisée jusqu'à Haeckel qui, en 1866, proposa la création d'un troisième règne, celui des "PROTISTES".

Le règne des protistes est scindé en deux groupes :

• Les protistes supérieurs - algues, champignons, protozoaires, possèdent, comme les plantes et les animaux, une organisation cellulaire complexe caractérisée principalement par l'existence d'un noyau : ce sont les cellules eucaryotes.

• Les protistes inférieurs, constitués par les bactéries, sont formés d'une cellule unique dépourvue de noyau : ce sont les cellules procaryotes.

Le microscope optique grossit 1000 fois : l'image qu'il donne des bactéries a donc une taille de l'ordre du millimètre.

Les formes des bactéries sont variées. On distingue :

	des formes rondes ou coques (coccus en latin, au pluriel cocci),
	des formes allongées en bâtonnet ou bacilles,
	des formes intermédiaires ou coccobacilles,
	des formes plus ou moins spiralées

Le matériel génétique

On trouve une unique molécule d'ADN. Celle-ci est circulaire : la molécule est refermée sur elle même. Cette molécule est appelée le chromosome bactérien. Il a l'air attaché à l'enveloppe bactérienne au niveau du mésosome. Cet ADN n'est pas nu : il est lié à des protéines, analogues des histones chez les eucaryotes. La zone où l'on trouve le chromosome est le nucléoïde.

Il y a d'autres petites molécules d'ADN circulaires (plusieurs kbases) : les plasmides. Ce sont des éléments génétiques mobiles.

Il peut y avoir réplication du chromosome bactérien (mécanismes des cercles tournant) suivie d'un division de la bactérie mais ce n'est pas une mitose.

Chez les procaryotes, la transcription et la traduction peuvent se dérouler simultanément compte tenu de l'absence de noyau.

Les bactéries sont des organismes asexués, la reproduction se fait par division cellulaire. Une cellule (appelée cellule mère) va donner naissance à deux cellules identiques appelées cellules filles, qui à leur tour deviennent mères, etc...
Population de bactéries avec de nombreuses cellules en cours de division.
Dans un milieu favorable une population de bactéries double toutes les 20 minutes environ.