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Virologie 

Un virus se caractérise par son incapacité à se multiplier par division. Il a besoin pour cela d'utiliser une cellule hôte : un virus est un parasiteintracellulaire obligatoire.

Les virus sont des entités avec des génomes constitués d'élément d'acide nucléique qui se répliquent à l'intérieur de cellules vivantes en utilisant le machinerie de synthèse cellulaire pour la synthèse d'éléments spécialisés appelés VIRIONS qui sont capables de transférer leur génome à d'autres cellules. (virion = particule virale)

Remarque : les virus affectant l'homme sont constitués de gènes très proches des gènes des cellules humaines (et non des gènes bactériens)

L'icosaèdre est un polyèdre obtenu par l'assemblage de 20 triangles équilatéraux (icosa = 20) :

les virus complexes :

• les Poxvirus

Leur forme rappelle celle d'un petit bacille. En coupe j , un nucléoïde central semble entouré d'une coque protéique déprimée au centre par deux corps latéraux.

Une membrane externe apparaît comme recouverte d'une série de tubes composés d'une double rangée de sous-unités sphériques réparties au hasard (virus de la variole k ) ou sous la forme d'un filament continu encerclant la particule (virus Orf du mouton l ).

Les phages caudés

JS

	A. nonenveloped virus, B. enveloped virus. 1. Capsid 2. Nucleic acid 3. Capsomer 4.Nucleocapsid 5. Virion 6. Envelope 7. Spike (envelope glycoproteins) Un virus se caractérise par son incapacité à se multiplier par division. Il a besoin pour cela d'utiliser une cellule hôte
Basic structure of viruses.

• Généralités
  
  -Définition :
  Parasite intracellulaire obligatoire ne pouvant se multiplier qu'à l'intérieur d'une cellule hôte et utilisant sa machinerie cellulaire.
  Il contient :
  -Une information génétique sous forme d'ADN ou d'ARN
  -Une structure de protection souvent protéique, compacte, pour protéger son Acide Nucléique : La Capside
  On peut ainsi classer les virus en 2 catégories :
  les virus possédant une capside à symétrie icosaédrique (ou encore hexagonale)
  les virus possédant une capside à symétrie hélicoïdale (comme le virus de la mosaïque du tabac).
  Le virus prend le pouvoir dans la cellule infectée: tous les systèmes de la cellule sont canalisés pour fabriquer du virus.

  Un virus présente les caractéristiques suivantes :

  • il ne contient qu'un seul acide nucléique, soit RNA soit DNA.

  • c'est un parasite intracellulaire obligatoire car incapable de participer au métabolisme énergétique (aucun enzyme du métabolisme n'est produite en particulier pour la synthèse des protéines), détournant l'expression génétique de la cellule hôte.

  • il possède un mode particulier de multiplication diffèrent de la mitose ou de la multiplication bactérienne comprenant un parasitisme du DNA de l'hôte.

  • il est de petite taille (inférieure à 0,30 µm environ) et passe au travers des filtres 0,22 µm.

  • il présente une structure pratiquement cristalline donc particulièrement bien définie. Cette structure n'est pas cellulaire, c'est à dire que même entourée d'une membrane enveloppe, on ne peut pas considérer qu'il s'agisse d'une cellule.

  définition de Wolf (1957):

  • un virus contient un seul type d'acide nucléique : ADN ou ARN
  • l'information génétique portée doit être décodée par une cellule
  • le virus nécessite pour son développement un parasitisme intracellulaire absolu
  • ils possèdent une structure spécifique qui les opposent aux autres vivants à structure cellulaire, c'est à dire aux cellules pro et eucaryotes

  On prendra garde au fait que certaines bactéries sont parasites intracellulaires absolus (Chlamydiae, Mycobacterium leprae, Treponema pallidum.

• Elément caractéristique de protection : CAPSIDE et ENVELOPPE

1. La Capside
   
   La Capside est une structure qui protège le génome du virus (génome qui est souvent de petite taille). Le virus utilise un nombre de gène minimale pour constituer cette capside formée de brique identiques,les protéines de capside.
   
   Il existe 2 grand type de structure de capside:
   les virus à structure hélicoïdale et les virus à structure icosaédrique (cubique).
   
   a. Structure à symétrie hélicoïdale
   
   On peut définir un virus à symétrie hélicoïdal par 5 paramètre:
   -Le nombre de sous-unités protéiques par tour
   -Le pas de l'hélice
   -L'angle f (angle formé entre l'axe central de la capside et le barycentre de 2 sous-unités)
   -le nombre d (distance entre 2 sous-unités)
   -la longueur de l'hélice
   
   Un bon exemple de virus possédant ce type de structure est le Virus de la Mosaïque du Tabac (TMV)

   Les virus atteignent toutes les cellules eucaryotes ou procaryotes. On divise donc le monde des virus en fonction des hôtes avec :

   • les virus animaux (avec les virus de vertébrés et les virus des invertébrés)
   • les virus végétaux
   • les virus des champignons
   • les virus des protozoaires
   • les virus des procaryotes ou bactériophages

   Certains virus, comme certains parasites animaux, se partagent entre une vie chez l'animal vertébré et une vie chez l'insecte vecteur. (fièvre jaune, etc...) Ils ont peut-être alors un rôle dans les échanges de DNA entre espèces.

   VIRUS ET BACTERIES

   Les virus sont-ils des microbes ou des molécules ? En un mot, sont-ils vivants ?

   réponse :

   " Les virus sont... des virus " (André Lwoff - Prix Nobel en 1970)

   Un virus se résume à une information génétique protégée

    

   • aucun virus ne peut fabriquer de ribosomes

   • aucun virus ne peut générer de l'ATP

    

   C'est la cellule, dans laquelle ils ont introduit leur génome, qui multiplie les virus.

   1° - dans le milieu extérieur :

   les virus sont des particules inertes : les virions

   au sein d'une population virale appartenant à la même espèce, forme et taille sont identiques parce que les virions ne sont concernés ni par des phénomènes de croissance, ni par des processus de division.

   c'est à cause de cette identité de forme et de taille que, dans certaines conditions, on peut cristalliser des virus.

   2° - à l'intérieur d'une cellule :

   le génome viral s’exprime : 

   - le génome est libéré de sa capside
   - la synthèse des macromolécules cellulaires s'interrompt
   - la cellule réplique le génome viral
   - la cellule synthétise les protéines de structure virales

   génome et protéines virales s'assemblent ensuite pour former de nouvelles particules virales qui sont libérées dans le milieu extracellulaire.

   ce n'est qu'à l'intérieur d'une cellule que l'information génétique des virus peut s'exprimer : à ce moment-là seulement on peut considérer que les virus sont " vivants ".

   Toutefois, il ne convient pas de considérer les virus comme des organismes vivants : ce sont des gènes parasites.

   Ils s’apparentent aux éléments génétiques mobiles : le génome de certains virus (le virus du sida en particulier) peut s’intégrer dans celui de la cellule-hôte !

Le virus est constitué au centre de l'acide nucléique (ARN ou ADN) en périphérie d'une capside protéique protégeant l'acide nucléique (avec lequel elle forme la "nucléocapside" ou "core") et parfois d'une enveloppe qui peut être hérissée de spicules permettant au virus de se fixer aux cellules et d'y pénétrer ou d'en sortir

Source

• http://anne.decoster.free.fr/d1viro/indexvir.html

• http://membres.lycos.fr/neb5000/VirologieI/page1.htm

• http://membres.lycos.fr/microbio/virologie/Virologie.html

• http://fr.wikipedia.org/wiki/Image:Virion.png

• http://www.cbmg.umd.edu/research/virology/links.html

• http://biblio.ut.edu.co/dir-web/e.htm

LINKS

• Sociedad Española de Virología  «En esta página se incluye información sobre la Junta Directiva, Estatutos, Socios y actividades de la Sociedad, así como enlaces de interés tanto para los miembros de la SEV como para cualquier persona relacionada academica o profesionalmente con el campo de la Virología.» España

• Sociedad Española de Enfermería Oncológica

• Northeast Association for Clinical Microbiology and Infectious Disease (NACMID)

• European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID) «ESCMID is a non-profit organisation whose mission is to improve the diagnosis, treatment and prevention of infectious diseases by promoting and supporting research, education and training in the infection disciplines. This is achieved by scientific exchange, educational programmes, grants and awards, certification and consultation with professional and government agencies. Through its activities and publications ESCMID fosters professional exchange and stimulates an open and collaborative spirit nourished by the diversity of European culture.»
  Europa

• Sickle Cell Society «The Sickle Cell Society was first set up as a registered charity in 1979. It was formed by a group of patients, parents and health professionals who were all concerned about the lack of understanding and the inadequacy of treatment for sufferers of sickle cell disorders in the UK. Our vision is to be the most successful sickle cell organisation nationally with a wide network of well-informed, committed and active supporters working at local, national and international levels. Then we will be better able to empower and assist people with sickle cell disorders to achieve their full economic and social potential. We hope that the following pages will provide you with a better understanding of the work which the Society does. Only by working together can we achieve this vision.»
  Reino Unido

• http://www.iah.bbsrc.ac.uk/virus/picornaviridae/  Este sitio, denominado Rotavirus Online, es un recurso que presenta las ultimas investigaciones sobre enfermedades ocasionadas por rotavirus y la elaboración de vacunas para combatirlas: base de datos sobre los hallazgos relavantes, grupos de discución para intercambiar información sobre el tema, una faq (Frequently Asked Questions) sobre la infección por rotavirus, etc).

• http://www.tulane.edu/~dmsander/garryfavweb.html  

  Sitio que ofrece información sobre Picornavirus. Además permite enlaces (links) a páginas relacionadas con el tema (enfermedad vesicular porcina, meningitis enteroviral, miocardítis viral, infecciones producidas por picornavirus, cardiovirus, infecciones en humanos por enterovirus, hepatitis tipo A al E, detección de enterovirus usando métodos moleculares, investigaciones sobre picornavirus, etc.). Institución: Institute for Animal Health, Pirbright Laboratory, EUA.
   

  All the virology on the WWW, http://www.virology.net (fig. 1), la más extensa recopilación de recursos de virología en Internet, editada por el Garry Laboratory de la Universidad de Tulane, Nueva Orleans, Estados Unidos, bajo de dirección de David M. Sander; merece la pena visitar el Big Picture Book of Viruses (fig. 2), debido a su popularidad cuenta con mirrors o páginas espejo en el Reino Unido, China y España en español http://virologia.ua.es.

  Virology Down Under http://www.uq.edu.au/vdu/ index. html, un gran recurso australiano de virología, su información incluye enlaces, tutoriales y mucho más.

  Clasificación y nomenclatura de los virus - The Index Virum http://life.anu.edu.au/viruses, contiene las listas de taxonomía vírica que reflejan la clasificación aprobada por el International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV).

  Institute for Molecular Virology at the University of Wisconsin-Madison http://www.bocklabs.wisc.edu/ Welcome.html, incluye descripciones de sus líneas de trabajo, complementadas con enlaces de interés, microscopía y animaciones.

  The Irish National Virus Reference Laboratory Home Page, http://www.ucd.ie/%7Evirusref/vrlhome.html (fig. 3). Lo más destacado de la WEB del University College Dublin, es Virus Alert el boletín del Laboratorio de Referencia de Virus.

  Virology Institute Marburg, http://www.med.uni-marburg.de/wwwmzh/eviro.htm.Investigación en influenza, paramyxovirus, citomegalovirus, filovirus y hantavirus.

  National Virology Institute, Sudáfrica. http://www.niv. ac.za/ Presenta información del Witwatersrand Department of Virology, en Johanesburgo. Mensualmente publica temas de interés y revisiones.

  The Research Laboratory for Vector-borne Diseases (LVD) (NRC-HTV), http://www.smd.be/msw/eng/r&d/ rlvbd/index.htm Laboratorio de investigación de infecciones por vectores en Bélgica. Contiene gran información de los serotipos europeos de hantavirus.

  The Institute of Human Virology http://www.ihv. org/default.html (fig. 4), de la Universidad de Maryland, del cual es director Robert C. Gallo.

  Antiviral Agents Bulletin. http://www.bioinfo.com/antiviral.html Información actualizada sobre agentes antivirales.

  Department of Microbiology and Immunology. Lecture Notes and Resources in Virology University of Rochester http://www.urmc.rochester.edu/gebs/faculty/stephen_Dewhurst.htm, contiene tutoriales sobre diferentes virus de interés, versión en español en http://www.medynet.com/ usuarios/nnuneza/indexviral.html

  Revistas de Virología en Internet, (tabla 1) en Internet se pueden encontrar la gran mayoría de revistas dedicadas a la virología, en la tabla se destacan un gran número de ellas.

  La formación continuada puede seguirse entre otras en:

  Department of Microbiology and Immunology. Leicester University. http://www-micro.msb.le.ac.uk/335/BS335. html, dirigido por Alan Cann.

  Viremia Page (fig. 5) http://www.umu.se/virology/alistair/ first.htm, página muy bien estructurada, con tutoriales interactivos en javascript.

  La adquisición de libros de virología es posible on-line visitando la WEB de La librería de la Virología http://www.virology.net/Bookpage/Bookshop.html

  En español:

  La presencia de páginas WEB en Internet en lengua española es menor que las de procedencia anglosajona, pero poco a poco van apareciendo recursos propios de gran calidad y se consiguen los permisos para la adaptación y edición en español de las grandes páginas de la virología mundial.

  Toda la Virología en la WWW ­ http://virologia.ua.es. Mirror de All the Virology on the WWW, alojada en la Universidad de Alicante.

  Gesida ­ Grupo de Estudio de sida de la Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica (SEIMC). http://www.gesidaseimc.com (fig. 6).

  Sociedad Española de Virología (SEV)­ http://www. tdi.es/sev, página oficial de la SEV.

  Virología y análisis clínicos (fig. 7) ­ http://virologia.ua.es/ acortesborra, página pionera de la virología en castellano, actualmente forma parte de la gran aportación del servidor de la Universidad de Alicante, junto con el Grupo de Virólogos Vall d'Hebron http://virologia.ua. es/gvvh, y el ya comentado mirror español del All the Virology on the WWW.

  Virología - http://www.medynet.com/usuarios/nnuneza/indexviral.html, versión española de la WEB de virología de la Universidad de Rochester.

  Página de Hepatitis en español- http://personal1. iddeo.es/ret003pb , WEB dedicada a las hepatitis en general con un futuro muy esperanzador como portal temático en español.

  VIH y SIDA ­ http://www.ctv.es/USERS/fpardo/home. html. Magnífica recopilación de recursos, tutoriales, estrategias de prevención.

  Grupos de noticias

  Grupos de noticias de temática virológica, para acceder a los mismos es preciso disponer de un lector de noticias tipo Free-Agent^® o un gestor de correo electrónico tipo Netscape^® o Microsoft Outlook^® , en estos grupos de noticias se puede participar en discusiones sobre diagnóstico, tratamiento o epidemiología de diversas infecciones víricas:

  bionet.virology http://www.bio.net/hypermail/VIROLOGY/, muy activo

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